欢迎访问《茶叶科学》,今天是

不同品种(系)凤凰单丛茶DNA指纹图谱的构建

  • 马瑞君 ,
  • 梅洪娟 ,
  • 庄东红 ,
  • 杨培奎 ,
  • 吴清韩
展开
  • 1. 韩山师范学院生物系,广东 潮州 521041;
    2. 汕头大学理学院生物系,广东 汕头 515063
马瑞君(1956— ),女,甘肃兰州人,教授,主要从事植物生态学研究,E-mail: marjhs@foxmail.com

收稿日期: 2014-02-20

  修回日期: 2014-05-05

  网络出版日期: 2019-09-03

基金资助

广东省科技计划项目(2011B020304012)、广东省高等学校科技创新重点项目(cxzd1131)

Construction of DNA Fingerprints in Fenghuang Dancong Tea of Different Cultivars (or Lines)

  • MA Ruijun ,
  • MEI Hongjuan ,
  • ZHUANG Donghong ,
  • YANG Peikui ,
  • WU Qinghan
Expand
  • 1. Biology Department of Hanshan Normal Uiversity, Chaozhou 521041, China;
    2. Biology Department of Science College of Shantou University, Shantou 515063, China

Received date: 2014-02-20

  Revised date: 2014-05-05

  Online published: 2019-09-03

摘要

为能够快速、准确地对不同品种(系)凤凰单丛茶进行鉴定,建立不同品种(系)凤凰单丛茶的DNA指纹图谱,本研究利用ISSR分子标记技术,以4份凤凰单丛茶品种为材料,对UBC802~UBC899等58条ISSR引物进行筛选,得到了12条多态性好的ISSR引物。在确定引物最佳退火温度后,利用这12条ISSR引物对39份凤凰单丛茶进行了扩增,结果显示,从其中筛选出的6条核心引物共扩增出84条带,平均每个引物扩增出14条带,其中多态性条带78条,多态性条带比例为92.86%,多态信息量平均为0.9456,其中引物UBC843多态性最为丰富,品种相似性系数在0.4063~0.9836之间;为将39份凤凰单丛茶品种全部区分开,本研究对6条核心引物进行了组合,发现其中UBC827/UBC846的组合鉴别效率最高;通过综合品种名称、国家地区编号、采样地点、高效核心引物组合名称以及ISSR数据代码,本研究建立了39种凤凰单丛茶的DNA指纹代码。之后,通过整合软件录入如品种指纹图谱代码、香型、海拔、ISSR-PCR扩增数据图片等更多相关信息,形成指纹图谱二维编码,构成凤凰单丛茶的DNA指纹图谱,为凤凰单丛茶品种权益保护及信息平台的建立提供数据支持。

本文引用格式

马瑞君 , 梅洪娟 , 庄东红 , 杨培奎 , 吴清韩 . 不同品种(系)凤凰单丛茶DNA指纹图谱的构建[J]. 茶叶科学, 2014 , 34(5) : 515 -524 . DOI: 10.13305/j.cnki.jts.2014.05.013

Abstract

The aim of this study is to quickly and accurately identify different cultivars (or lines) of Fenghuang Dancong tea in which would construct a DNA fingerprint in different cultivars (or lines) of Fenghuang Dancong tea based on ISSR molecular marker. Firstly, 58 ISSR primers were screened with 4 cultivars, indicating 12 of which are polymorphic. After screening the optimal annealing temperature, 12 ISSR primers were used to amplify 39 Fenghuang Dancong tea resources. The results showed that by using 6 reliable ISSR primers, 84 DNA fragments, among which 78 DNA bands were polymorphic, of all 39 tea accessions were amplified. And the polymorphic proportion of DNA bands (PPB) was 92.86%, including the primer UBC843 with the richest polymorphic, and the average number of DNA bands amplified by each primer was 14. The average polymorphism information content (PIC) was 0.9456, and the genetic similarity coefficient of the 39 accessions ranged from 0.4063 to 0.9836. In order to identify all 39 accessions, it indicated that the combination efficiency of UBC827/UBC846 was the highest by making combination of the 6 core ISSR primers. By connecting the name of cultivars, the national area code, the sampling sites, the name of the highest efficient primer combination and the ISSR data code, the DNA fingerprint codes of 39 Fenghuang Dancong tea were built. And then, the relevant information of the sample such as its flavor type, altitude, ISSR-PCR amplified picture and so on, were all typed in the software to generate the two-dimensional code fingerprint. The construction of the DNA fingerprint in different cultivars (or lines) of Fenghuang Dancong tea could offer data support for the protection of the cultivars rights and interests.

参考文献

[1] 方金福. 潮州凤凰茶区古茶树见闻录[J]. 茶业通报, 2005, 27(1): 20-21.
[2] 陈国本, 赵超艺, 李家贤. 谈凤凰单丛茶资源及保护——关于资源评价及保护的若干话题[J]. 广东茶叶, 2005, 21(1): 13-16.
[3] 黄柏梓. 中国凤凰茶[M]. 深圳: 海天出版社, 2003: 13-83.
[4] 罗一帆, 郭振飞. 广东岭头单丛茶高效液相色谱指纹图谱的研究[J]. 食品科学, 2005, 26(4) : 206-209.
[5] 王玉娟, 张彦, 房经贵, 等. 利用基于RAPD标记的MICD法快速鉴定72个葡萄品种[J]. 中国农业科学, 2012, 45(14): 2913-2922.
[6] 金惠淑, 梁月荣, 陆建良. 中、韩两国主要茶树品种基因组DNA多态性比较研究[J]. 茶叶科学, 2001, 21(2): 103-107.
[7] Mondal Kumar Tapan.Assessment of genentic diversity of tea (Camellia sinensis (L.)O.Kuntze )by inter-simple sequence repeat polymerase chain reaction[J]. Euphytica, 2002, 128: 307-315.
[8] 乔小燕, 陈亮, 乔婷婷, 等. 基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析[J]. 中国农业科学, 2011, 44(16): 3297-3311.
[9] 晏嫦妤, 罗军武, 李家贤, 等. 利用AFLP技术鉴定凤凰单丛古茶树种质资源[J]. 基因组学与应用生物学, 2009,28(1): 89-93.
[10] 汪云刚, 刘本英, 孙雪梅, 等. 应用ISSR标记对茶树新品种佛香茶亲本的鉴定[J]. 西北农业学报, 2011, 20(7): 149-154.
[11] 沈程文, 黄建安, 赵世浩, 等. 利用SRAP和ISSR标记分析广东茶树种质资源的遗传多样性[J]. 核农学报, 2010, 24(5): 948-955.
[12] 刘本英, 汪云刚, 孙雪梅, 等. 利用ISSR和EST-SSR标记分析茶树遗传多样性的比较[J]. 热带作物学报, 2009, 30(11): 1577-1583.
[13] 姚明哲, 陈亮, 马春雷, 等. ISSR和EST-SSR标记在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种遗传多样性上的比较分析[J]. 分子植物育种, 2009, 7(5): 897-903.
[14] 凤凰镇人民政府. 中国凤凰单丛茶图谱[M]. 潮州: 海天出版社, 2011: 13-83.
[15] 吴清韩. 潮州凤凰单丛茶形态学性状及ISSR遗传多样性研究[D]. 兰州: 西北师范大学, 2012: 1-3.
[16] 刘本英, 孙雪梅, 李友勇, 等. 20个云南无性系茶树良种的DNA指纹图谱构建[J]. 热带作物学报, 2011, 32(4): 720-727.
[17] 刘本英, 王平盛, 周红杰, 等. 云南茶组植物ISSR-PCR反应体系的建立[J]. 云南农业大学学报, 2006(增): 21-25.
[18] 杨培奎. 粤东地区橄榄种质资源遗传多样性ISSR分析及核心种质初步构建[D]. 汕头: 汕头大学, 2010: 24-28.
[19] 宋海斌, 崔西波, 栾非时, 等. 基于SSR标记的甜瓜品种(系)DNA指纹图谱库的构建[J]. 中国农业科学, 2012, 45(13): 2676-2689.
[20] 刘本英, 李友勇, 成浩, 等. 云南茶树资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR分析[J]. 作物学报, 2010, 36(3): 391-400.
[21] 李传代. 女贞ISSR分子标记的引物筛选[J]. 热带生物学报, 2010(2): 183-187.
[22] 王心宇, 陈佩度. ISSR标记在小麦指纹图谱分析中的应用研究初探[J]. 农业生物技术学报, 2001, 9(3): 261-263.
[23] 郭长奎, 罗淑萍. 新疆主要玉米杂交种及亲本ISSR鉴定和指纹图谱数据库的构建[J]. 新疆农业科学, 2009, 46(1): 34-39.
[24] 吕亚丽. 不同玉米品种蛋白质指纹图谱和DNA指纹图谱的构建[D]. 呼和浩特: 内蒙古农业大学, 2006: 41-42.
[25] Zhao Weiguo, Miao Xuexia, Pan Yi-Le, et al. Construction of fingerprinting and genetic diversity of Mulberry cultivars in China by ISSR markers[J]. Acta Genetica Sinica, 2006, 33(9): 851-860.
[26] 汪斌, 祁伟, 祁建民, 等. 应用ISSR分子标记绘制红麻种质资源DNA指纹图谱[J]. 作物学报, 2011, 37(6): 1116-1123.
[27] 雷天刚, 何永睿, 陈善春, 等. 柑橘栽培品种(系)DNA指纹图谱库的构建[J]. 中国农业科学, 2009, 42(8): 2852-2861.
[28] 兰龙辉, 邱荣祖. 二维码技术在农产品物流追溯系统中的应用[J]. 物流工程与管理, 2013(9): 86-89.
文章导航

/