用SSR分子标记研究茶组植物种间亲缘进化关系

doi:10.13305/j.cnki.jts.2009.5.003

茶叶科学 ›› 2009, Vol. 29 ›› Issue (5): 341-346.doi: 10.13305/j.cnki.jts.2009.5.003

用SSR分子标记研究茶组植物种间亲缘进化关系

王丽鸳¹, 刘本英¹, 姜燕华¹, 段云裳², 成浩^1,*, 周健¹, 唐一春³

1. 中国农业科学院茶叶研究所,国家茶树改良中心,浙江杭州 310008;
2. 南京农业大学,江苏南京 210095;
3. 云南农业科学院茶叶研究所,云南勐海 666201

收稿日期:2009-04-08 修回日期:2009-06-09 出版日期:2009-10-15 发布日期:2019-09-09
通讯作者: * E-mail：chenghao@mail.tricaas.com
作者简介:王丽鸳（1978— ）,女,浙江金华人,助理研究员,主要从事茶树遗传育种和茶叶生物工程研究。

Phylogenetic Analysis of Interspecies in Section Thea Through SSR Markers

WANG Li-yuan¹, LIU Ben-ying¹, JIANG Yan-hua¹, DUAN Yun-shang², CHENG Hao^1,*, ZHOU Jian¹, TANG Yi-chun³

1. Tea Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences; National Center for Tea Improvement, Hangzhou 310008, China;
2. Nanjing Agricultural University; Nanjing 210095, China;
3.Tea Research Institute of Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Menghai 666201, China

Received:2009-04-08 Revised:2009-06-09 Online:2009-10-15 Published:2019-09-09

摘要/Abstract

摘要： 本研究利用50对来自茶系的SSR引物对41份茶组资源进行PCR扩增,研究不同类型SSR引物的通用性和多样性指数。研究结果表明,茶系的SSR引物在茶组植物中的通用性高,其中EST-SSR通用性多态位点的比例达到60%。另外,利用SSR标记技术对茶组材料的遗传多样性进行分析。不同位点在种间的等位基因数为2~6个,平均每个位点4.21个等位基因。通过UPGMA方法构建了茶组12个种的遗传进化关系图。

关键词: 茶组, 遗传进化分析, SSR, 通用性

Abstract: For the purpose of investigating the transferability and polymorphism information content (PIC) of different types of SSR primers, PCR amplification for 41 accessions from section thea was conducted in this investigation. The results showed that the SSR primers form Ser. Sinensis were highly transferable among section Thea. The polymorphic and transferable primers account for 60% of EST-SSR markers. Then the genetic diversity among 12 species of section Thea was evaluated through SSR analysis. The number of alleles in different loci ranged from 2 to 6, with average 4.21 per locus. The phyolgenetic dendrogram was constructed by the UPGMA.

Key words: section Thea, phylogenetic analysis, SSR marker, transferability

中图分类号:

S571.1
Q311

王丽鸳, 刘本英, 姜燕华, 段云裳, 成浩, 周健, 唐一春. 用SSR分子标记研究茶组植物种间亲缘进化关系[J]. 茶叶科学, 2009, 29(5): 341-346. doi: 10.13305/j.cnki.jts.2009.5.003.

WANG Li-yuan, LIU Ben-ying, JIANG Yan-hua, DUAN Yun-shang, CHENG Hao, ZHOU Jian, TANG Yi-chun. Phylogenetic Analysis of Interspecies in Section Thea Through SSR Markers[J]. Journal of Tea Science, 2009, 29(5): 341-346. doi: 10.13305/j.cnki.jts.2009.5.003.

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Phylogenetic Analysis of Interspecies in Section Thea Through SSR Markers

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