茶尺蠖普通气味结合蛋白（GOBP）的基因克隆与序列分析

doi:10.13305/j.cnki.jts.2010.01.006

茶叶科学 ›› 2010, Vol. 30 ›› Issue (1): 37-44.doi: 10.13305/j.cnki.jts.2010.01.006

茶尺蠖普通气味结合蛋白（GOBP）的基因克隆与序列分析

陈华才¹, 刘军¹, 张晓燕¹, 殷坤山²

1. 中国计量学院,浙江杭州 310018;
2. 中国农业科学院茶叶研究所,浙江杭州310008

收稿日期:2008-12-22 修回日期:2009-08-13 发布日期:2019-09-10
作者简介:陈华才（1968— ）,男,湖北浠水人,研究员,博士,研究方向为昆虫化学生态与分子生物学。huacaichen@cjlu.edu.cn
基金资助:
浙江省自然科学基金（Y305130）

Cloning and Sequence Analysis of EoblGOBP in the Antennal of Ectropis obliqua hypulina

CHEN Hua-cai¹, LIU Jun¹, ZHANG Xiao-yan¹, YIN Kun-shan²

1. China Jiliang University, Hangzhou 310018, China;
2. Tea Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310008, China

Received:2008-12-22 Revised:2009-08-13 Published:2019-09-10

摘要/Abstract

摘要： 以触角总RNA为模板,根据同源性设计简并性引物,采用RT-PCR扩增结合RACE技术克隆获得了茶尺蠖（Ectropis obliqua）普通气味结合蛋白GOBP1和GOBP2基因的cDNA全长序列。分别命名为EoblGOBP1和EoblGOBP2。EoblGOBP1的cDNA全长为1 528 bp,开放阅读框501 bp,编码166个氨基酸残基,预测分子量Mw=18 835.63 D,等电点pI=5.45,cDNA和氨基酸序列在NCBI/GenBank的登录号分别为FJ156732和ACN29680.1。EoblGOBP2的cDNA全长为1 315 bp,开放阅读框405 bp,编码160个氨基酸残基,预测分子量Mw=18 002.75 D,等电点pI=5.32。cDNA和氨基酸序列在NCBI/GenBank的登录号分别为FJ156733和ACN29681.1。两个气味结合蛋白的氨基酸序列中都含有6个保守的半胱氨酸位点,具有气味结合蛋白的典型特征,与已报道的鳞翅目昆虫气味结合蛋白的同源性为分别62%~82%和76%~88%。

关键词: 茶尺蠖, 普通气味结合蛋白（GOBP）, 全长序列, 基因克隆, 序列分析

Abstract: The full-length sequences of two general odorant binding protein (GOBP) genes in Ectropis obliqua (named EoblGOBP1 and EoblGOBP2) were cloned with degenerated digonudeotide primers by RT-PCR and the rapid amplification of cDNA ends (RACE) using the total RNA isolated from the antenna of Ectropis obliqua as template. The length of EoblGOBP1 was 1 528 bp with a 501bp ORF which encoded a peptide of 166 amino acid residues. The predicted Mw and pI of the peptide were 18 835.63 D and 5.45 respectively. The NCBI/GenBank accession numbers of cDNA and amino acid of EoblGOBP1were FJ156732 and ACN29680.1, respectively. The length of EoblGOBP2 was 1 315 bp with a 405 bp ORF which encoded a peptide of 160 amino acid residues. The predicted Mw and pI of the peptide were 18 002.75 D and 5.32 respectively. The GenBank accession numbers of cDNA and amino acid of EoblGOBP2 were FJ 156733 and ACN29681.1, respectively. The amino acid sequences from the two gene sequences had 6 typical conservative Cys. Blast searching in NCBI showed that the amino acid sequences were highly similar to that of other GOBPs from Lepidoptera with sequence identities of 62%~82% and 76%~88%.

Key words: Ectropis oblique, general odorant binding protein, full-length sequence, gene cloning, sequence analysis

中图分类号:

S571.1
S476

陈华才, 刘军, 张晓燕, 殷坤山. 茶尺蠖普通气味结合蛋白（GOBP）的基因克隆与序列分析[J]. 茶叶科学, 2010, 30(1): 37-44. doi: 10.13305/j.cnki.jts.2010.01.006.

CHEN Hua-cai, LIU Jun, ZHANG Xiao-yan, YIN Kun-shan. Cloning and Sequence Analysis of EoblGOBP in the Antennal of Ectropis obliqua hypulina[J]. Journal of Tea Science, 2010, 30(1): 37-44. doi: 10.13305/j.cnki.jts.2010.01.006.

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茶尺蠖普通气味结合蛋白（GOBP）的基因克隆与序列分析

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