低温胁迫下茶树基因表达的差异分析

doi:10.13305/j.cnki.jts.2008.04.011

茶叶科学 ›› 2008, Vol. 28 ›› Issue (4): 249-254.doi: 10.13305/j.cnki.jts.2008.04.011

低温胁迫下茶树基因表达的差异分析

邹中伟, 房婉萍^*, 张定, 段云裳, 黎星辉^*

南京农业大学茶叶科学研究所,江苏南京 210095

收稿日期:2008-04-18 出版日期:2008-08-15 发布日期:2019-09-12
通讯作者: *,fangwp@njau.edu.cn
作者简介:邹中伟（1984— ）,男,硕士研究生,主要从事茶叶生物化学与生物技术研究。
基金资助:
教育部高校博士点基金（20060307024、20070307020）; 中国博士后科学基金（20070411061）; 常州市科技攻关项目（CE2007210）

Analysis of Differential Expression Genes in Cold-induced Tea Plant

ZOU Zhong-wei, FANG Wan-ping^*, ZHANG Ding, DUAN Yun-shang, LI Xing-hui^*

Tea Science Research Institute, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China

Received:2008-04-18 Online:2008-08-15 Published:2019-09-12

摘要/Abstract

摘要： 利用cDNA-AFLP技术分析了茶树在低温胁迫下的基因表达差异。用16对引物（256个组合）对三个样品池进行了差异条带的筛选,结果表明,在冷胁迫不同处理时期相关基因表达存在显著差异,共获得了86个差异片段。在选择回收的10条差异表达cDNA片段中,经克隆测序,Blast序列同源性检索,显示其中片段1与一种低温和盐胁迫响应蛋白有77%的同源性,片段5与拟南芥冷诱导表达相关60 s ribosomal protein L7(RPL7B)有89%的同源性;片段8与一种逆境诱导蛋白（Stress-induced H1-Histone protein）有79%的同源性;片段9与干旱条件下的EST序列有着较高的同源性,其它6个片段在GenBank数据库中未找到相似序列,可能为新基因。

关键词: cDNA-AFLP, 茶树, 冷胁迫, 表达差异

Abstract: The differential expression was investigated between cold-induced and normal environment in tea plant (Camellia sinensis) with cDNA-AFLP (cDNA Amplified Fragments Length Polymorphism). Expression profiles were generated around 86 special cDNA fragments (16 pairs primer, 256 primer combinations). Ten differentially expressed transcript-derived fragments were isolated. Cha1 revealed similarities (77%) to one kind of low temperature and salt responsive protein in Arabidopsis thaliana. Cha5 revealed similarities (89%) to Arabidopsis thaliana 60 S ribosomal protein L7 (RPL7B), ChaH8 had high similarities (79%) to Nicotiana tabacum A10 mRNA for stress-inducible H1 histone-like protein. Cha9 had high similarities to Populus EST from severe drought-stressed opposite wood. Other 6 fragments showed no homology to the known sequences in GenBank, perhaps they were new genes.

Key words: cDNA-AFLP, tea plant (Camellia sinensis), cold-stress, expression

中图分类号:

S571.1
Q523

邹中伟, 房婉萍, 张定, 段云裳, 黎星辉. 低温胁迫下茶树基因表达的差异分析[J]. 茶叶科学, 2008, 28(4): 249-254. doi: 10.13305/j.cnki.jts.2008.04.011.

ZOU Zhong-wei, FANG Wan-ping, ZHANG Ding, DUAN Yun-shang, LI Xing-hui. Analysis of Differential Expression Genes in Cold-induced Tea Plant[J]. Journal of Tea Science, 2008, 28(4): 249-254. doi: 10.13305/j.cnki.jts.2008.04.011.

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Analysis of Differential Expression Genes in Cold-induced Tea Plant

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